MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 3513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022045	AG	3	6	74	79	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022045	CTTT	2	8	156	163	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022045	CT	4	8	215	222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022045	TTG	2	6	278	283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022045	AAT	2	6	295	300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022045	AACGAC	2	12	450	461	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022045	GAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022045	CAT	2	6	537	542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022045	CTT	2	6	570	575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_022045	CGA	2	6	646	651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022045	CTT	2	6	673	678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_022045	TAA	2	6	692	697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022045	CTT	2	6	712	717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_022045	CCT	2	6	786	791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_022045	CTT	2	6	792	797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022045	TGC	2	6	799	804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022045	CTG	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022045	CTT	2	6	1035	1040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022045	CAT	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022045	TGTCT	2	10	1102	1111	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022045	C	6	6	1152	1157	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_022045	T	6	6	1174	1179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022045	CTT	2	6	1277	1282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022045	CT	3	6	1360	1365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022045	CTT	2	6	1409	1414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022045	A	7	7	1475	1481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022045	CGAT	2	8	1572	1579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022045	ACG	2	6	1626	1631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022045	TTTC	2	8	1685	1692	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022045	TGT	2	6	1752	1757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022045	TCT	2	6	1766	1771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022045	TAG	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022045	GCT	2	6	1805	1810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022045	AGC	2	6	1942	1947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022045	CAA	2	6	2008	2013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022045	TTA	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022045	CTT	2	6	2076	2081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022045	TCA	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022045	CCT	2	6	2139	2144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_022045	A	7	7	2167	2173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022045	CTG	2	6	2232	2237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022045	AAT	2	6	2243	2248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022045	GTC	2	6	2346	2351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022045	CTTGT	2	10	2361	2370	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022045	AGTT	2	8	2373	2380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022045	ATA	2	6	2383	2388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022045	TTAC	2	8	2416	2423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022045	AAAT	2	8	2475	2482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022045	T	6	6	2487	2492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022045	GCT	2	6	2538	2543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313891
51	NC_022045	CTGT	2	8	2680	2687	0 %	50 %	25 %	25 %	530313891
52	NC_022045	T	7	7	2738	2744	0 %	100 %	0 %	0 %	530313891
53	NC_022045	TC	3	6	2797	2802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022045	CTT	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313892
55	NC_022045	TCT	2	6	2911	2916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313892
56	NC_022045	ATCA	2	8	2934	2941	50 %	25 %	0 %	25 %	530313892
57	NC_022045	GAC	2	6	2942	2947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313892
58	NC_022045	TGG	2	6	2954	2959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313892
59	NC_022045	GATA	2	8	2993	3000	50 %	25 %	25 %	0 %	530313892
60	NC_022045	TGC	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313892
61	NC_022045	CCAT	2	8	3107	3114	25 %	25 %	0 %	50 %	530313892
62	NC_022045	GCC	2	6	3145	3150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530313893
63	NC_022045	AAT	2	6	3201	3206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313893
64	NC_022045	GCTT	2	8	3212	3219	0 %	50 %	25 %	25 %	530313893
65	NC_022045	A	6	6	3249	3254	100 %	0 %	0 %	0 %	530313893
66	NC_022045	AAT	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022045	ATT	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022045	ATT	2	6	3421	3426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022045	ATT	2	6	3434	3439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022045	AT	3	6	3449	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022045	TATT	2	8	3501	3508	25 %	75 %	0 %	0 %	530313894
72	NC_022045	GAA	2	6	3518	3523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313894
73	NC_022045	T	6	6	3550	3555	0 %	100 %	0 %	0 %	530313894
74	NC_022045	AAC	2	6	3561	3566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313894
75	NC_022045	AAAG	2	8	3594	3601	75 %	0 %	25 %	0 %	530313894
76	NC_022045	ATTAA	2	10	3627	3636	60 %	40 %	0 %	0 %	530313894
77	NC_022045	ATT	2	6	3642	3647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313894
78	NC_022045	CT	3	6	3662	3667	0 %	50 %	0 %	50 %	530313894
79	NC_022045	CAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313894
80	NC_022045	AAT	2	6	3713	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313894
81	NC_022045	TTGT	2	8	3738	3745	0 %	75 %	25 %	0 %	530313894
82	NC_022045	AGAAA	2	10	3755	3764	80 %	0 %	20 %	0 %	530313894
83	NC_022045	ATC	2	6	3768	3773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313894
84	NC_022045	AT	3	6	3781	3786	50 %	50 %	0 %	0 %	530313894
85	NC_022045	T	6	6	3788	3793	0 %	100 %	0 %	0 %	530313894
86	NC_022045	A	6	6	3797	3802	100 %	0 %	0 %	0 %	530313894
87	NC_022045	ATC	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313894
88	NC_022045	ACC	2	6	3856	3861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313894
89	NC_022045	TG	3	6	3906	3911	0 %	50 %	50 %	0 %	530313894
90	NC_022045	T	6	6	3942	3947	0 %	100 %	0 %	0 %	530313894
91	NC_022045	T	6	6	4071	4076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022045	T	6	6	4150	4155	0 %	100 %	0 %	0 %	530313873
93	NC_022045	TAG	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313873
94	NC_022045	TAT	2	6	4212	4217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313873
95	NC_022045	TGG	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313873
96	NC_022045	CAA	2	6	4320	4325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313873
97	NC_022045	AAG	2	6	4347	4352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313873
98	NC_022045	ACA	2	6	4373	4378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313873
99	NC_022045	CAT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313873
100	NC_022045	CGG	2	6	4435	4440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530313873
101	NC_022045	AT	3	6	4546	4551	50 %	50 %	0 %	0 %	530313873
102	NC_022045	AAT	2	6	4736	4741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313873
103	NC_022045	TGGT	2	8	4758	4765	0 %	50 %	50 %	0 %	530313873
104	NC_022045	TGG	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313873
105	NC_022045	ATTC	2	8	4847	4854	25 %	50 %	0 %	25 %	530313873
106	NC_022045	ATT	2	6	4901	4906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313873
107	NC_022045	TCT	2	6	4937	4942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313873
108	NC_022045	GAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313873
109	NC_022045	AGA	2	6	4975	4980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313873
110	NC_022045	AGC	2	6	4981	4986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313873
111	NC_022045	TGGT	2	8	5023	5030	0 %	50 %	50 %	0 %	530313873
112	NC_022045	GC	3	6	5073	5078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022045	ATA	2	6	5173	5178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022045	GAA	2	6	5179	5184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022045	TA	3	6	5248	5253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022045	CTT	2	6	5325	5330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
117	NC_022045	AAG	2	6	5345	5350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
118	NC_022045	GAA	3	9	5377	5385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
119	NC_022045	GAA	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
120	NC_022045	TTC	2	6	5536	5541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
121	NC_022045	TCT	2	6	5570	5575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
122	NC_022045	AGT	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313895
123	NC_022045	CAC	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313895
124	NC_022045	ATG	2	6	5726	5731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313895
125	NC_022045	CGA	2	6	5741	5746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313895
126	NC_022045	CAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313895
127	NC_022045	TG	3	6	5906	5911	0 %	50 %	50 %	0 %	530313895
128	NC_022045	ATA	2	6	5933	5938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313895
129	NC_022045	ACA	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313895
130	NC_022045	GTT	2	6	5989	5994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313895
131	NC_022045	TTC	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
132	NC_022045	AGA	2	6	6068	6073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
133	NC_022045	CAA	2	6	6114	6119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313895
134	NC_022045	ACT	2	6	6125	6130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313895
135	NC_022045	TGC	2	6	6163	6168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313895
136	NC_022045	CAA	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313895
137	NC_022045	T	6	6	6205	6210	0 %	100 %	0 %	0 %	530313895
138	NC_022045	AGA	2	6	6264	6269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313895
139	NC_022045	ACC	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313895
140	NC_022045	AGT	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313895
141	NC_022045	ATG	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313895
142	NC_022045	TCT	2	6	6500	6505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313895
143	NC_022045	AAGA	2	8	6530	6537	75 %	0 %	25 %	0 %	530313895
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159	NC_022045	ATT	2	6	7311	7316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313897
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258	NC_022045	ATT	2	6	11571	11576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_022045	A	7	7	11581	11587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_022045	CTC	2	6	11588	11593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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277	NC_022045	ATT	2	6	12375	12380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313903
278	NC_022045	CCT	2	6	12385	12390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
279	NC_022045	GCT	2	6	12441	12446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313904
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282	NC_022045	CCT	2	6	12555	12560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313904
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354	NC_022045	AAT	2	6	14929	14934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_022045	T	7	7	16491	16497	0 %	100 %	0 %	0 %	530313909
404	NC_022045	ATC	2	6	16505	16510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313909
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407	NC_022045	T	7	7	16579	16585	0 %	100 %	0 %	0 %	530313910
408	NC_022045	TC	4	8	16591	16598	0 %	50 %	0 %	50 %	530313910
409	NC_022045	A	6	6	16632	16637	100 %	0 %	0 %	0 %	530313910
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414	NC_022045	TAAT	2	8	16794	16801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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416	NC_022045	TTC	2	6	16922	16927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_022045	ACT	2	6	20790	20795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313915
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500	NC_022045	AACAT	2	10	21556	21565	60 %	20 %	0 %	20 %	530313915

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